3. الأنظمة البيئية المائية الانتقالية

هى نوع من أنواع الأنظمة البيئية المائية التي تجمع ما بين مياه البرك والجداول والمحيطات، ويُطلق عليها هذا الاسم لأنها تختلط باليابسة، إلى جانب أنها يحدث فيها اختلاط المياه العذبة بالمياه المالحة، وذلك مثل تعد المستنقعات شكل من أشكال الأنظمة البيئية المائية الانتقالية التي تتسم بكثافة مياهها إلى جانب أن بيئتها تحفز النباتات على النمو.
من أبرز أنواع الكائنات التي تعيش في الأنظمة البيئية المائية الانتقالية اللافقاريات البحرية مثل المحار، إلى جانب عدد من أنواع الأسماك، إلى جانب الطيور مثل البط التي تعتمد على هذا النظام أثناء موسم الهجرة.